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识别威胁新生儿的肠道细菌

导读 来自Quadram研究所和东英吉利大学的研究人员已经确定了是什么使一些肠道细菌菌株在早产儿中危及生命。这些发现现在发表在《自然微生物学》

来自Quadram研究所和东英吉利大学的研究人员已经确定了是什么使一些肠道细菌菌株在早产儿中危及生命。这些发现现在发表在《自然微生物学》杂志上,将有助于识别和跟踪危险的菌株,并保护脆弱的新生儿。

对极低出生体重新生儿的主要威胁是坏死性小肠结肠炎(NEC)。这种微生物感染在足月婴儿中很少见,利用破坏肠道组织的脆弱性,导致严重的并发症。五分之二的病例是致命的。

引起特别突然和严重疾病的一种细菌是产气荚膜梭菌。这些在环境中很常见,非致病菌株生活在健康的人体肠道中。

那么,是什么让某些菌株在早产儿中如此危险呢?

来自Quadram研究所和UEA的Lindsay Hall教授和Raymond Kiu博士领导了对早产儿产气荚膜梭菌基因组的首次重大研究,其中包括一些患有坏死性小肠结肠炎的婴儿。

研究小组分析了来自五个英国新生儿重症监护室(NICU)收治的70名婴儿粪便样本的产气荚膜梭菌基因组。基于基因组的相似性,他们发现一组引起疾病的能力较低。这允许与毒性更强的菌株进行比较。毒性较低的群体缺乏负责产生称为PFO的毒素以及定植和生存所需的其他因子的基因。

这项研究已经开始构建与健康早产儿和坏死性小肠结肠炎相关的产气荚膜梭菌的基因组特征。

来自UEA诺里奇医学院和Quadram研究所的Lindsay Hall教授说:“探索数百个产气荚膜梭菌基因组的基因组特征使我们能够区分在早产肠道中无害的'好'细菌菌株,以及与破坏性和致命疾病坏死性小肠结肠炎相关的'坏'细菌菌株。

“我们希望这些发现将有助于'追踪'非常脆弱的患者群体 - 早产儿的致命产气荚膜梭菌菌株。

可能需要在更多地点和更多样本中进行更大规模的研究,但这项研究可能有助于确定控制坏死性小肠结肠炎的更好方法。

该团队之前曾与Paul Clarke教授以及诺福克和诺里奇大学医院NICU的临床同事一起工作。他们展示了为新生儿提供益生菌补充剂的好处。

新生儿的小肠结肠炎肠道微生物组被严重破坏,使其容易受到产气荚膜梭菌过度生长的影响。

霍尔教授说:“我们的基因组研究为我们提供了更多的数据,我们可以将其用于对抗导致婴儿疾病的细菌 - 我们正在利用另一种微生物居民双歧杆菌的好处,为高危婴儿提供最好的生命开端。

来自Quadram研究所的Raymond Kiu博士说:“重要的是,这项研究强调全基因组测序是识别新细菌谱系和确定菌株水平细菌毒力因子的有力工具,使我们能够更好地了解疾病。